Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms