Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms