Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms