Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms