Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms