Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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