Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms