Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms