Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms