Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPAS3Q8IXF0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms