Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms