Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms