Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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