Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms