Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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