Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms