Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms