Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM28Q13263 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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