Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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