Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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