Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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