Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms