Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITIH3Q06033 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITIH3Q06033 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms