Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms