Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FPGSQ05932 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms