Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms