Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms