Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms