Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTRNP46939 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms