Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD6P30203 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD6P30203 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD6P30203 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms