Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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