Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPRR1BP22528 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms