Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFTRP13569 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFTRP13569 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFTRP13569 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFTRP13569 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFTRP13569 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFTRP13569 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFTRP13569 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms