Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms