Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms