Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB1P08034 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB1P08034 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB1P08034 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms