Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3P05106 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms