Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPLO60437 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPLO60437 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPLO60437 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.4 ms