Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms