Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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