Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms