Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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