Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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