Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SATB2Q9UPW6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms