Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms