Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRNP25Q9BV90 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRNP25Q9BV90 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRNP25Q9BV90 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms