Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIFA3Q9BQP9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms