Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms