Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREX2Q9BQ50 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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