Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms